军队的传染病防治工作，依照《传染病防治法》和国家有关规定办理，由（）实施监督管理。

答案解析：本题考查的是《中华人民共和国传染病防治法》中的相关内容。根据《传染病防治法》的规定，军队的传染病防治工作，依照本法和国家有关规定办理，由中国人民解放军卫生主管部门实施监督管理。A、国务院：国务院负责全国的行政管理，但军队的传染病防治工作不由国务院直接监督管理。B、中央军委：中央军委是中国军队的最高军事领导机构，主要负责军事工作，不直接负责传染病防治工作的监督管理。C、国务院卫生行政部门：国务院卫生行政部门主要负责全国卫生工作的行政管理，但军队的传染病防治工作有其特殊性，不由国务院卫生行政部门直接监督管理。D、中国人民解放军卫生主管部门：根据《传染病防治法》规定，军队的传染病防治工作由中国人民解放军卫生主管部门实施监督管理，因此选项D正确。综上，正确答案是D，中国人民解放军卫生主管部门。