我们常用的抗生素主要是为了对抗哪种生物？

答案解析：抗生素主要是用于治疗由细菌引起的感染。它们通过抑制细菌的生长或直接杀死细菌来发挥作用。病毒与细菌在生物特性上有很大不同，抗生素对病毒通常是无效的，因此对抗病毒需要使用抗病毒药物。所以，我们常用的抗生素主要是为了对抗细菌。选项B是正确的。