答案解析：明朝时期的特务机构厂卫系统主要由以下几个部分组成：1. 锦衣卫：成立于明太祖朱元璋时期，最初是皇帝的亲军，负责皇帝的仪仗和警卫。后来逐渐演变为兼管刑狱、监视和侦查官民言行的特务机构。2. 东厂：成立于明成祖朱棣时期，由宦官掌管，主要负责监视和侦查官民，权力极大，甚至可以干预司法。3. 西厂：成立于明宪宗朱见深时期，也是由宦官掌管，权力和职能与东厂类似，但规模和活动范围更大。4. 内行厂：成立于明武宗朱厚照时期，由宦官刘瑾设立，主要负责监督东厂和西厂，权力更甚。在这四个机构中，锦衣卫是最早设立的，且在厂卫系统中占有重要地位。除了东西厂和内行厂之外，另一个重要的特务机构就是锦衣卫。
